拓撲化學，是超理化學的一門新興分支學科，主要研究元素間的拓撲結構變換。
拓撲化學主要研究在更強的發功條件下，拓撲結構相同的字母之間的相互轉換。
如：Pd中，字母P和字母d各有一個環，而O2中，每個字母O各有一個環，所以有以下超理反應：
Pd==發強功==O2
（歡迎補充）
拓撲化學擴展了超理反應中一貫使用的狹義字母守恆定律，將超理反應中對守恆的理解提升到了新的高度。
